為學生的終身發展服務,培養具有現代理念、嚴格自律、基礎扎實、能力全面、身心健康、人格成熟、個性鮮明、富于創造的現代公民。教育理念:讓學生在思考、實踐和創造活動中成長和發展。學校的座右銘：良好的教學和學習。學校精神：誠信，追求美與和諧。教學風格：注重真理，追求新奇與真實。學校口號：給孩子一個新的教育。經營學校的概念：人的方向和治理。讓每個孩子得到最好的發展，讓每個家庭享受最大的幸福。

學校本科教育涵蓋醫、理、工、管、經、法6 個學科門類，設有26 個專業。研究生教育涉及醫學、理學2 個學科門類，其中，一級學科授權點4個，專業學位授權類別5 個，二級學科授權點29 個（含一級學科覆蓋點）。有國家級特色專業1 個、省級特色專業9 個、國家級專業綜合改革試點專業1 個、省級專業綜合改革試點專業11 個，省級重點學科2 個、“十三五”省臨床優先發展重點專科1 個、省臨床重點專科3 個、省臨床重點培育專科2 個。

學校重視師資隊伍建設和學科帶頭人培養。現有專任教師656人，其中高級職稱276人。近年來有7 名教師分別榮膺全國、全省優秀教師光榮稱號，13 人享受國務院特殊津貼，現有省高校學科拔尖人才2 人，省學術和技術帶頭人7 人、后備人選13 人。

學校注重教學科研團隊和平臺建設。現有省級人才培養模式創新實驗區1 個，省級教學團隊8 個，省級卓越人才教育培養計劃7 項，省級精品資源課程23 門，省級示范實驗實訓中心3 個。有國家藥物臨床試驗機構1個、國家中醫藥管理局三級實驗室1 個、省級重點實驗室等省級科研平臺3個、省級校企合作實踐教育基地4 個，公開出版《皖南醫學院學報》《中國臨床藥理學與治療學》2 種學術期刊。

學校積極開展對外交流與合作，先后與美國、英國、德國等國家以及香港、臺灣地區的高校及研究機構廣泛開展學術合作交流；與美國Barrow神經病研究所、安徽海關（原安徽出入境檢驗檢疫局）、南京軍區南京總醫院、先聲藥業集團等國內企事業單位和科研院所開展實踐教學、科研攻關等方面的合作。

學校始終堅持人才培養中心地位，深化實踐教育、社會責任教育和創新創業教育“三位一體”人才培養模式改革，促進人才培養質量不斷提高。畢業生深受用人單位和社會各界好評，就業率始終保持在97％以上，位居全省高校前列，多次榮獲省就業工作先進單位稱號。建校以來，已為國家輸送了近六萬名醫療衛生人才，為我省乃至全國的醫療衛生事業發展作出了積極的貢獻。

在60 年的辦學歷程中，學校秉承“精醫、尚德、求實、自強”的校訓，發揚“艱苦創業，求實自強，奉獻社會”的皖醫精神，實施“質量立校、學科引校、特色興校、人才強校、依法治校”五大發展戰略，努力建設地方特色高水平大學的發展目標。面對新形勢新任務，學校將以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，堅持“以本為本”，堅持“四個回歸”，堅持內涵式發展，全面提升辦學實力和人才培養質量，辦好人民滿意的大學，為建設“五大發展”美好安徽、服務人民大眾健康、全面小康做出新的更大貢獻。