新疆巴音郭楞蒙古自治州衛生學校又叫巴州衛生學校，學校是巴州地區唯一的一所全日制普通中等醫學職業學校，位于庫爾勒市交通西路。學校最早創辦于1958年，后來因為十年文革停辦，在1975年的時候才恢復辦學。

學校目前有在職教職工122名，其中少數民族44人（蒙古族11人、維吾爾族29人、土家族1人、滿族1人、回族1人、烏孜別克族1人）；在職教師中專任教師69人，全日制在校生3642名，其中民族學生比例為52.5%。現開設有 護理、 助產、 衛生保健、 藥劑、 醫學檢驗技術、 醫學影像技術、 中西醫結合、中醫針灸推拿、 眼視光技術等9個專業。

學校占地面積81244.96平方米，教學行政用房面積40952.42平方米。教學儀器設備總值1130.0萬元。教學用計算機238臺,電子閱覽室1間,多媒體教室11間，語音室1間，多功能學術廳1間，大禮堂1座。圖書館建筑面積1816.0平方米，有紙質藏書6萬冊，電子圖書及其它視聽資料30萬冊。運動場所總面積15326平方米，包括300米塑膠環形跑道，600平方米的室內運動場地，能夠滿足體育教學和各類活動的需要。學校現設有護理、臨床、語言等9個教研組。建有護理示教室、護理技術綜合訓練室、ICU模擬病房、婦幼愛嬰模擬病房、醫學綜合訓練室等專業實驗室42間。有護理、助產、衛生保健、藥劑等9個中職醫學專業，建立了34個穩定的校外實訓基地。

經過幾代人的努力和近幾年的快速發展，特別是2005年被評為國家級重點中等職業學校，開始大規模面向全疆招生，2006年、2007年通過自治區衛生廳組織的專家組的評估，學校護理、衛生保健等兩個專業被列為自治區重點專業以來，各項工作更是得到了快速發展，取得了一系列驕人的成績：1998年被自治區衛生廳確定為自治區五所重點衛護校之一，2000年通過自治區教育廳、衛生廳聯合組織的中等醫學教育專業設置認定，2003年通過自治區合格中等學校評估，成為新疆保留的四所衛校之一，并被自治區人事廳、衛生廳確定為“自治區衛生院專業技術人員繼續醫學教育基地”，2004年被國家教育部等六部委確定為“國家護理專業技能型緊缺人才培訓基地”，2005年被國家教育部確立為國家級重點中等職業學校，同年掛牌成立了“巴州地區第一國家職業技能鑒定所”、“巴州衛校職業技能培訓中心”、 “自治區全科醫師崗位培訓基地和實踐培訓基地”、 “巴州衛生局培訓中心”，2006年護理、衛生保健兩個專業被自治區評為重點示范專業，2007年在全疆衛生職業學校專業辦學條件評估中取得優異成績。2008年在新疆首屆中等衛生職業教育在校生“天堰杯”護士風采大賽中，獲得團體三等獎。2008年我校《護理學基礎》課程通過了自治區教育廳精品課程答辯。學校先后獲得“中國青年志愿者杰出集體”、“全國醫療衛生信息化教育項目優秀組織獎”、“自治區級文明單位”、“自治區教育系統先進單位”“自治區職業學校思想政治教育科研工作先進單位”、“自治區“三育”人先進集體”“自治區全科醫師優秀培訓基地”“自治區中等專業學校后勤管理先進單位”、 “自治州教育系統校務公開先進單位”、“自治州衛生人才培訓先進集體”、“自治州青少年民族團結進步先進集體”、“自治州文化衛生發展年先進集體”等一系列榮譽稱號。